Thomas Müller ist Abteilungsleiter im Bundesgesundheitsministerium, Abteilung 1 „Arzneimittel, Medizinprodukte, Biotechnologie“, zu der auch das Referat Apotheken gehört. Er ist von Hause aus Arzt und Apotheker, war Leiter der Krankenhausapotheken unter anderem am Universitätsklinikum Rostock. 2007 übernahm er die Leitung der Abteilung Arzneimittel beim Gemeinsamen Bundesausschuss (G-BA). Im April 2018 holte der damalige Gesundheitsminister Jens Spahn (CDU) ihn ins BMG.